TY  - SER
AU  - Григорьева,Евгения Сергеевна
AU  - Краснов,Георгий Сергеевич
AU  - Литвяков,Николай Васильевич
AU  - Лисицын,Николай Александрович
AU  - Воевода,Михаил Иванович
AU  - Белковец,Анна Владимировна
AU  - Афанасьев,Сергей Геннадьевич
AU  - Чердынцева,Надежда Викторовна
AU  - Волкоморов,Виктор Владимирович
TI  - Идентификация маркеров аденокарциномы желудка на основе биоинформатического поиска и анализа генной экспрессии
KW  - аденокарцинома желудка
KW  - гистология человека
KW  - гены маркерные
KW  - генетическая база данных
KW  - экспрессия генов
KW  - PMEPA1, белок
KW  - SPARC, ген
KW  - полимеразные цепные реакции
KW  - статьи в журналах
N1  - Библиогр.: 20 назв
N2  - Введение. Одна из важных задач современной онкологии – поиск ассоциированных с опухолями молекулярных маркеров, которые могут использоваться для диагностики и прогнозирования рака, оценки степени радикальности операции и последующего лечения, а также раннего выявления рецидивов. Одним из продуктивных вариантов подобного поиска является анализ транскриптомных баз данных с применением методов биоинформатики с последующей валидацией полученных результатов на клиническом материале.Цель исследования – поиск мембранных белков, которые могут быть использованы для сывороточной диагностики аденокарциномы желудка интестинального гистологического типа.Материалы и методы. Идентификацию потенциальных маркеров рака желудка (РЖ) проводили с использованием баз данных Gene Ontology и the Cancer Genome Atlas (TCGA). Последующую оценку дифференциальной экспрессии генов выполняли на парных образцах аденокарциномы и нормальной ткани желудка, взятых от 55 пациентов. Экспрессию генов оценивали с помощью полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией в режиме реального времени по методу ΔCq.Результаты. Сравнительный анализ уровней синтеза матричных РНК (мРНК) нормальных и опухолевых тканей с применением нового алгоритма биоинформатического поиска привел к идентификации 3 наиболее высококопийных транскриптов (SULF1, PMEPA1 и SPARC), внутриклеточное содержание которых заметно повышается при РЖ. При анализе уровня мРНК данных генов в клиническом материале наблюдалось более чем двукратное увеличение уровня экспрессии PMEPA1 и SPARC в 75 % образцов РЖ интестинального гистологического типа. В образцах РЖ диффузного гистологического типа этот показатель составил 25 и 38 % соответственно.Выводы. Использование оригинального биоинформатического подхода, основанного на анализе данных TCGA, позволило выявить 2 гена (PMEPA1 и SPARC), преимущественно экспрессирующихся в опухолях желудка интестинального типа. Полученные результаты свидетельствуют об актуальности дальнейшего исследования роли этих генов в патогенезе РЖ и оценки клинической значимости уровня их экспрессии в опухолевой ткани
UR  - http://vital.lib.tsu.ru/vital/access/manager/Repository/vtls:000587156
ER  -