Scientific Library of Tomsk State University

   E-catalog        

Image from Google Jackets
Normal view MARC view

Изучение методами молекулярной динамики структур белков Nip7 глубоководных и мелководных архей в условиях повышенного давления К. Е. Медведев, Д. А. Афонников, Ю. Н. Воробьев

By: Медведев, Кирилл ЕвгеньевичContributor(s): Афонников, Дмитрий Аркадьевич | Воробьев, Юрий НиколаевичMaterial type: ArticleArticleOther title: Molecular dynamics study of high pressure influence on the structure of Nip7 protein from deep-sea and shallow-water archaea [Parallel title]Subject(s): РНК-связывающие белки | Pyrococcus, род | археи | пьезофилы | компьютерное моделирование | молекулярная динамика белков | белки | растворителиGenre/Form: статьи в журналах Online resources: Click here to access online In: Вестник Томского государственного университета. Биология № 4. С. 136-145Abstract: Исследовано влияние высокого давления на структурные характеристики РНК-связывающего белка Nip7 глубоководных и мелководных архей рода Pyrococcus методами моделирования молекулярной динамики и компьютерного анализа. Исследована доступность остатков растворителю и значение среднеквадратичного отклонения С-α атомов (RMSD) при разных значениях давления. Полученные данные свидетельствуют о том, что РНК-связывающий домен белка Nip7 более устойчив к влияниям высокого давления у глубоководного вида. Кроме того, анализ компьютерных моделей белков Nip7 из P. abyssi и P. furiosus показал, что с увеличением давления площадь поверхности белка, доступной растворителю, уменьшается. Для моделей Nip7 P. abyssi эта площадь меньше и ее относительные изменения меньше, чем у Nip7 из P. furiosus.
Tags from this library: No tags from this library for this title. Log in to add tags.
No physical items for this record

Библиогр.: 17 назв.

Исследовано влияние высокого давления на структурные характеристики РНК-связывающего белка Nip7 глубоководных и мелководных архей рода Pyrococcus методами моделирования молекулярной динамики и компьютерного анализа. Исследована доступность остатков растворителю и значение среднеквадратичного отклонения С-α атомов (RMSD) при разных значениях давления. Полученные данные свидетельствуют о том, что РНК-связывающий домен белка Nip7 более устойчив к влияниям высокого давления у глубоководного вида. Кроме того, анализ компьютерных моделей белков Nip7 из P. abyssi и P. furiosus показал, что с увеличением давления площадь поверхности белка, доступной растворителю, уменьшается. Для моделей Nip7 P. abyssi эта площадь меньше и ее относительные изменения меньше, чем у Nip7 из P. furiosus.

There are no comments on this title.

to post a comment.